As curtas do IndieJúnior Porto participam num concurso com a possibilidade de ganhar três prémios.

O vencedor do Prémio do Público do IndieJúnior é escolhido pelo público todo do festival. As votações feitas no boletim de voto no fim das diferentes sessões serão o factor decisivo neste prémio.

O Prémio Impacto é oferecido pela Reitoria da Universidade do Porto. Este prémio tem como objetivo premiar um filme pela importância temática, cuidado estético e criatividade. A atribuição deste é feita por um júri composto por elementos da universidade e jovens estudantes do ensino secundário.

O Prémio APEI (Associação de Profissionais de Educação de Infância) é um prémio novo criado este ano. Este prémio pretende destacar um filme da competição destinado à primeira infância.